Mandraki is de hoofdstad van Nissyros. De havenplaats met zijn witte huizen, ligt tegen een heuvel aangeplakt en ziet er vanaf de zee erg mooi uit. Wat meteen opvalt is de ruïne van het kasteel van Spiliani, op de hoge rots. Vanuit Mandraki kun je eigenlijk maar via één geasfalteerde weg naar de andere locaties op het eiland. In Mandraki zelf zijn er een aantal tavernes en overnachtingsmogelijkheden. De kade waar vandaan de boot vertrekt is vlakbij en aan de haven is het mogelijk om een scooter te huren. Maar je kunt in veel gevallen ook de scooter meenemen op de boot, dan ben je meteen verzekerd van vervoer.